Er zijn twee bronnen van molybdeen in het milieu

(1) Door verwering komt molybdeen vrij uit rotsen. Er wordt geschat dat 1,000 ton ervan jaarlijks in waterlichamen en bodems terechtkomt en door het milieu migreert. Een ongelijkmatige verdeling van molybdeen veroorzaakt in sommige gebieden “bodem- en waterziekten” vanwege het gebrek aan molybdeen, en in sommige gebieden “jichtziekten” (bijvoorbeeld in Armenië) vanwege het hoge molybdeengehalte.
(ii) De bredere toepassing van molybdeen bij menselijke activiteiten en de verbranding van molybdeenhoudende fossiele brandstoffen (bijvoorbeeld steenkool) hebben de hoeveelheid molybdeen die in het milieu circuleert vergroot. De wereldwijde productie van molybdeen bedraagt ​​100.000 ton per jaar, en jaarlijks wordt 800 ton molybdeen verbrand en in het milieu terechtgekomen. De hoeveelheid molybdeen die door menselijke activiteiten aan de cyclus wordt toegevoegd, overschrijdt de natuurlijke cyclus. De industrieën die molybdeen het meest gebruiken zijn de metallurgie, elektronica, raketten en ruimtevaart, atoomenergie, chemie en landbouw. Molybdeenvervuiling is niet voldoende onderzocht.

Het transport van molybdeen in het milieu houdt verband met de oxiderende en reducerende omstandigheden, de zuurgraad en alkaliteit van het milieu en de invloed van andere media. Hoe oxiderender en alkalischer het water en de bodem zijn, hoe gemakkelijker het voor molybdeen is om MoO-ionen te vormen; planten kunnen in deze toestand molybdeen opnemen. De zuurgraad van de omgeving neemt toe of de reduceerbaarheid neemt toe, molybdeen wordt gemakkelijk omgezet in complexe ionen en vormt uiteindelijk MoO; deze toestand van molybdeen wordt gemakkelijk hersteld door klei, bodemcolloïden en humuszuur en wordt inactief en kan niet door planten worden opgenomen. In de oceaan zorgt de reducerende omgeving van de diepzee ervoor dat molybdeen wordt geadsorbeerd door organische stoffen en vervolgens wordt verpakt in colloïden die mangaan bevatten, waardoor uiteindelijk knobbeltjes worden gevormd die naar de bodem van de zee zinken en uit de cyclus van de biosfeer worden verwijderd.
Molybdeen heeft een lage impact op warmbloedige dieren en vissen. Een hoog molybdeengehalte heeft een negatief effect op planten. Uit tests blijkt dat: een molybdeenconcentratie van 0.5 ~ 100 mg/liter wanneer de groei van vlas verschillende mate van impact zal hebben; 10 ~ 20 mg / liter wanneer de groei van sojabonen een schadelijk effect heeft; 25 ~ 35 mg/liter wanneer de groei van katoen licht schadelijk is; 40 mg/liter wanneer de groei van suikerbieten een schadelijk effect heeft. Wanneer de concentratie molybdeen in water 5 mg/l bereikt, wordt de biologische zelfzuivering van water geremd; bij 10 mg/l wordt dit effect nog meer geremd en heeft het water een sterk samentrekkende smaak; bij 100 mg/l vertraagt ​​de microbiële groei van het waterlichaam en heeft het water een bittere smaak. China bepaalt dat de maximaal toegestane concentratie molybdeen in grondwater 0,5 mg/l bedraagt, de maximaal toegestane concentratie oplosbaar molybdeen in de werkplaatslucht is 4 mg/m3; en onoplosbaar molybdeen is 6 mg/m3.